卵巢巧克力囊肿症状有个体差异，少部分人没有症状，多数人早期的表现为不正常的经痛，还会引起性交痛、盆腔包块以及女性不孕，所以女性朋友在发现疾病后一定要到医院明确病因进行对症治疗，以免造成更严重的后果。
遗传因素：巧克力囊肿患者一级亲属的患病率是没有家族史人的7倍，所以说可能是多基因遗传的影响。
内分泌因素：卵巢虽然不大，但是对于女性来说是非常重要的，卵巢是产生卵子并促成排卵、内分泌激素、平衡内分泌的重要器官之一，如果内分泌出现问题容易导致引起巧克力囊肿。
输卵管阻塞：由于输卵管有堵塞，导致子宫、卵巢内多余的垃圾排不出来，而在卵巢内堆积，形成巧克力囊肿。
生理原因：子宫内膜在正常情况下，在宫腔中生长，随生理期剥落、增厚。但是由于内膜在卵巢生长，导致内膜在卵巢淤积，内膜不断增厚而出现囊肿。
分娩、多次流产等也是卵巢巧克力囊肿发生的原因：巧克力囊肿是由于月经期子宫内膜碎片引流不畅导致的，影响月经血从阴道流出，包括多次人工流产后子宫颈口粘连、月经期性交等，都会促发巧克力囊肿。推选阅读 莆田妇科治疗卵巢囊肿有哪些方法
而现在比较认为的是经血倒流的学说：就是说女性在经期时子宫内膜腺上皮以及间质细胞可随着经血倒流，经输卵管进到腹腔，种植于卵巢以及盆腔腹膜，并在该处继续生长以及蔓延，形成盆腔内异症。先天性阴道闭锁或宫颈狭窄等经血潴留患者常并发内异症，说明经血倒流容易导致内膜种植。推选阅读 治疗卵巢囊肿哪种方法有效
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